根据海南自由贸易港建设总体方案，海南自贸港将在2025年封关运行，实施“一线放开，二线管住”的运营管理模式。届时，海南自由贸易港除负面清单以外的事项、商品外，将实现“全岛零关税”，绝大部分进口商品将享受“零关税”待遇。

此次，草案三次审议稿在草案二次审议稿相关条文中增加一款：全岛封关运作时，将增值税、消费税、车辆购置税、城市维护建设税及教育费附加等税费进行简并，在货物和服务零售环节征收销售税；全岛封关运作后，进一步简化税制。

草案三次审议稿还增加了“制定生态环境准入清单”“防范外来物种入侵”“实现可持续发展”相关内容。

2020年12月，十三届全国人大常委会对海南自由贸易港法草案进行了初次审议。今年4月，海南自由贸易港法草案再次提请十三届全国人大常委会审议。